Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Tcirg1Q9JHF5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms