Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERE7

Mesd, LRP chaperone MESD, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MesdQ9ERE7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
MesdQ9ERE7 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms