Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD7

Tubb3, Tubulin beta-3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb3Q9ERD7 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tubb3Q9ERD7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms