Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Capn12Q9ER56 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms