Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER42

Barx1, Homeobox protein BarH-like 1, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Barx1Q9ER42 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Barx1Q9ER42 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Barx1Q9ER42 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms