Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
SgshQ9EQ08 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SgshQ9EQ08 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms