Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBT3

Ccdc97, Coiled-coil domain-containing protein 97, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc97Q9DBT3 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ccdc97Q9DBT3 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Ccdc97Q9DBT3 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms