Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SrpraQ9DBG7 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms