Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ccdc89Q9DA73 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc89Q9DA73 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms