Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
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Usp12Q9D9M2 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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Usp12Q9D9M2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Usp12Q9D9M2 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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