Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Cntd1Q9D995 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms