Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ifrd2Q9D8U0 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms