Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Vstm5Q9D806 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms