Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ccdc94Q9D6J3 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ripor2-201ENSMUST00000038477 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc94Q9D6J3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms