Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccdc130Q9D516 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccdc130Q9D516 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms