Protein–RNA interactions for Protein: Q9D506

Gm3404, Predicted gene 3404, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3404Q9D506 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gm3404Q9D506 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms