Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
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PrameQ9D4Z5 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PrameQ9D4Z5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PrameQ9D4Z5 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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PrameQ9D4Z5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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PrameQ9D4Z5 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PrameQ9D4Z5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms