Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4F8

Tubgcp4, Gamma-tubulin complex component 4, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubgcp4Q9D4F8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tubgcp4Q9D4F8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms