Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
4933425L06RikQ9D3Z8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms