Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Myo16-201ENSMUST00000042103 6725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fchsd1-201ENSMUST00000043437 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpn1-201ENSMUST00000029053 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Nphs1-201ENSMUST00000006825 4608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Phf21a-202ENSMUST00000068702 6023 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cabin1-201ENSMUST00000001712 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Stk10-201ENSMUST00000102821 5026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 CT573086.2-201ENSMUST00000227277 4992 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Fam26e-201ENSMUST00000069125 5323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Piezo2-202ENSMUST00000047480 10724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Vwf-203ENSMUST00000112254 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Scn10a-204ENSMUST00000214408 5877 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
4933428G20RikQ9D3X4 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms