Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Rufy3Q9D394 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rufy3Q9D394 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms