Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Krt20Q9D312 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Krt20Q9D312 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms