Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1H8

Mrpl53, 39S ribosomal protein L53, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl53Q9D1H8 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Medag-201ENSMUST00000093110 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Mrpl53Q9D1H8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms