Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Lmbr1lQ9D1E5 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 5430405H02Rik-203ENSMUST00000185402 904 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Lmbr1lQ9D1E5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms