Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT4

Polr3e, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC5, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3eQ9CZT4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Polr3eQ9CZT4 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Polr3eQ9CZT4 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms