Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZR4

Cmtm8, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm8Q9CZR4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm8Q9CZR4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms