Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ44

Nsfl1c, NSFL1 cofactor p47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsfl1cQ9CZ44 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Nsfl1cQ9CZ44 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms