Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU5

Khdc3, KH domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Khdc3Q9CWU5 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Khdc3Q9CWU5 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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