Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Slc25a37-201ENSMUST00000037064 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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Ddx28Q9CWT6 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Ddx28Q9CWT6 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx28Q9CWT6 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx28Q9CWT6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx28Q9CWT6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx28Q9CWT6 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx28Q9CWT6 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
Ddx28Q9CWT6 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx28Q9CWT6 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.45□□□□□ -0.1
Ddx28Q9CWT6 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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