Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ly6kQ9CWP4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms