Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NubplQ9CWD8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.06□□□□□ -0.16
NubplQ9CWD8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms