Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
Higd2aQ9CQJ1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Higd2aQ9CQJ1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms