Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Q9CQC3 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Q9CQC3 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms