Protein–RNA interactions for Protein: Q99PM3

Gtf2a1, Transcription initiation factor IIA subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2a1Q99PM3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Rhbdl3-201ENSMUST00000017836 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Tle3-201ENSMUST00000034820 4646 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ccdc116-203ENSMUST00000115711 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gtf2a1Q99PM3 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ahcy-201ENSMUST00000054607 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Fam192a-201ENSMUST00000034226 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ap4b1-203ENSMUST00000106823 2741 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Zbtb5-202ENSMUST00000107817 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Armcx1-206ENSMUST00000113201 2228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Pak1-205ENSMUST00000206984 2794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Plcd3-201ENSMUST00000103077 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ntrk2-204ENSMUST00000224259 3049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Zfyve28-201ENSMUST00000094868 3983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Cacna2d2-204ENSMUST00000166799 3474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 4931414P19Rik-201ENSMUST00000022786 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Rinl-201ENSMUST00000059857 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Gtf2a1Q99PM3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms