Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
NsmfQ99NF2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NsmfQ99NF2 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms