Protein–RNA interactions for Protein: Q99MW3

Pramel1, Preferentially expressed antigen in melanoma-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramel1Q99MW3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Pramel1Q99MW3 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms