Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mccc1Q99MR8 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mccc1Q99MR8 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms