Protein–RNA interactions for Protein: Q99LH9

Sh3bp5l, SH3 domain-binding protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp5lQ99LH9 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sh3bp5lQ99LH9 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sh3bp5lQ99LH9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms