Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Usp16Q99LG0 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Usp16Q99LG0 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms