Protein–RNA interactions for Protein: Q99LB7

Sardh, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SardhQ99LB7 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SardhQ99LB7 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
SardhQ99LB7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms