Protein–RNA interactions for Protein: Q99KU0

Vmp1, Vacuole membrane protein 1, mousemouse

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmp1Q99KU0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Vmp1Q99KU0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Vmp1Q99KU0 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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