Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR6

Rnf34, E3 ubiquitin-protein ligase RNF34, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf34Q99KR6 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rnf34Q99KR6 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms