Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ciao1Q99KN2 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ciao1Q99KN2 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms