Protein–RNA interactions for Protein: Q923D4

Sf3b5, Splicing factor 3B subunit 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b5Q923D4 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Sf3b5Q923D4 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Sf3b5Q923D4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Sf3b5Q923D4 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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