Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Spdl1Q923A2 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Spdl1Q923A2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms