Protein–RNA interactions for Protein: Q922U1

Prpf3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf3Q922U1 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Prpf3Q922U1 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms