Protein–RNA interactions for Protein: Q920Q6

Msi2, RNA-binding protein Musashi homolog 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msi2Q920Q6 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Msi2Q920Q6 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms