Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Nek8Q91ZR4 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Nek8Q91ZR4 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms