Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
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Pde6cQ91ZQ1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Pde6cQ91ZQ1 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Pde6cQ91ZQ1 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Pde6cQ91ZQ1 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Pde6cQ91ZQ1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Pde6cQ91ZQ1 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Pde6cQ91ZQ1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Pde6cQ91ZQ1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
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Pde6cQ91ZQ1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
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Pde6cQ91ZQ1 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Pde6cQ91ZQ1 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
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