Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCD5

Med17, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med17Q8VCD5 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Med17Q8VCD5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Med17Q8VCD5 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms